<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
<style type="text/css" id="owaParaStyle"></style>
</head>
<body fpstyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Verdana;color: #000000;font-size: 10pt;">
Hi Shawn,
<div><br>
</div>
<div>> So far I get "no implicit conversion of Hash into Array" when submitting the job.</div>
<div><br>
</div>
<div>If you copied the source from OSC's "bc_osc_rstudio_server" Interactive App:</div>
<div><br>
</div>
<div><span style="font-size: 13.3333px;">https://github.com/OSC/bc_osc_rstudio_server/</span></div>
<div><br>
</div>
<div>then it sounds like your "submit.yml.erb" might have PBS/Torque specific references in it (this is what OSC uses). You should probably copy your "submit.yml.erb" that you used in your Jupyter app.</div>
<div>
<div><br>
</div>
<div>> Has anyone managed to get R Server working?</div>
<div><br>
</div>
<div>A couple centers have got RStudio Server working, although caution should be taken if you use OSC's "bc_osc_rstudio_server" Interactive App as it takes advantage of some features in the latest Dashboard app that aren't present in the OnDemand 1.2 release.</div>
<div><br>
</div>
<div>That leaves you with three options:</div>
<div><br>
</div>
<div>1. Manually update the Dashboard code from the GitHub repo, or wait until OnDemand 1.3 release in March</div>
<div>2. Volunteer to install the beta RPM we are currently developing</div>
<div>3. Modify the "bc_osc_rstudio_server" app so it works with the current Dashboard</div>
<div>  - I believe this means replacing "$(find_port ${host})" with just "$(find_port)" in the template files</div>
<div>  - Also, removing the "template/after.sh.erb" since it calls "wait_until_port_used" which doesn't exist yet</div>
<div><br>
</div>
<div>Also, you will need to install the dependencies on the compute nodes (see README.md). I believe both HPC centers went the route of using a Singularity image.</div>
<div><br>
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<div style="font-size:13px">
<div style="font-size:13px">
<div style="font-size:13px">
<div style="font-size:13px">
<div style="font-size:13px">
<div style="font-size:13px">
<div style="font-size:13px">
<div style="font-size:13px"><font face="Verdana">-- </font>
<div style=""><span style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; font-weight:bold; line-height:18px; background-color:rgb(255,255,255)"><font face="Verdana">Jeremy Nicklas</font></span></div>
<font face="Verdana"><span style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px; background:rgb(255,255,255)">Web and Interface App Engineer</span><br style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px">
<a tabindex="0" href="https://osc.edu/" style="color:rgb(207,16,45); text-decoration:none; font-size:12px; line-height:18px; background:rgb(255,255,255)">Ohio Supercomputer Center (OSC)</a><br style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px">
<span style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px; background-color:rgb(255,255,255)">A member of the </span><a tabindex="0" href="https://oh-tech.org/" style="color:rgb(207,16,45); text-decoration:none; font-size:12px; line-height:18px">Ohio
 Technology Consortium</a><br style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px">
<span style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px; background-color:rgb(255,255,255)">1224 Kinnear Road, Columbus, Ohio 43212</span><br style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px">
<span style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px; background-color:rgb(255,255,255)">Office: </span><a tabindex="0" href="tel:+16142926739" style="color:rgb(207,16,45); text-decoration:none; font-size:12px; line-height:18px">(614) 292-6739</a><span style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px; background-color:rgb(255,255,255)"> •
 Mobile: </span><a tabindex="0" href="tel:+16143166428" style="color:rgb(207,16,45); text-decoration:none; font-size:12px; line-height:18px">(614) 316-6428</a><span style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px; background-color:rgb(255,255,255)"> •
 Fax: </span><a tabindex="0" href="tel:+16142927168" style="color:rgb(207,16,45); text-decoration:none; font-size:12px; line-height:18px">(614) 292-7168</a><br style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px">
<a tabindex="0" href="mailto:jnicklas@osc.edu" style="color:rgb(207,16,45); text-decoration:none; font-size:12px; line-height:18px">jnicklas@osc.edu</a><br style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px">
<br style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px">
<span style="color:rgb(85,85,85); font-size:12px; line-height:18px; background-color:rgb(255,255,255)">Learn more about OSC at </span><a tabindex="0" href="https://osc.edu/" style="color:rgb(207,16,45); text-decoration:none; font-size:12px; line-height:18px">https://osc.edu</a></font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div style="font-family: Times New Roman; color: #000000; font-size: 16px">
<hr tabindex="-1">
<div id="divRpF139047" style="direction: ltr;"><font face="Tahoma" size="2" color="#000000"><b>From:</b> OOD-users [ood-users-bounces@lists.osc.edu] on behalf of Shawn Doughty [shawn.doughty@tufts.edu]<br>
<b>Sent:</b> Monday, February 26, 2018 8:56 PM<br>
<b>To:</b> User support mailing list for Open OnDemand<br>
<b>Subject:</b> [OOD-users] R Server<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div>Hi,<br>
<br>
</div>
Has anyone managed to get R Server working? I know it is not officially supported until the next release...  We have jupyter and jupyterlab working with pilot users (way cool!) and they are now clamoring to test R Server... and Matlab.<br>
<br>
</div>
So far I get "no implicit conversion of Hash into Array" when submitting the job.<br>
<div>
<div>
<div><br clear="all">
</div>
<div><br>
</div>
<div>-- <br>
<div class="gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr"><span style="font-family:'Segoe UI',Helvetica,Arial,sans-serif; font-size:13.600000381469727px">Shawn G. Doughty</span><br style="font-family:'Segoe UI',Helvetica,Arial,sans-serif; font-size:13.600000381469727px">
<span style="font-family:'Segoe UI',Helvetica,Arial,sans-serif; font-size:13.600000381469727px">Senior Research Technology Specialist</span>, Research Technology<br>
<span dir="ltr"><font face="Helvetica"><span style="font-weight:normal; font-variant:normal; text-transform:none"><span style="font-family:'Segoe UI',Helvetica,Arial,sans-serif; font-size:13.600000381469727px">Tufts Technology Services (TTS)</span></span></font></span><br>
16 Dearborn Road<br>
Somerville, MA 02144<br style="font-family:'Segoe UI',Helvetica,Arial,sans-serif; font-size:13.600000381469727px">
<span style="font-family:'Segoe UI',Helvetica,Arial,sans-serif; font-size:13.600000381469727px">617-627-5462<br>
</span><a href="https://exchange.tufts.edu/owa/redir.aspx?C=I4ijzFrF9U-qoUscfQAAw3PH17xA188ItQ-l2VPx05symHhOFT2FNSr8FiNXjMnyEtzrTlLLj-Q.&URL=http%3a%2f%2fit.tufts.edu%2f" style="font-family:'Segoe UI',Helvetica,Arial,sans-serif; font-size:13.600000381469727px" target="_blank">http://it.tufts.edu/</a></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>