
<html><head></head><body><div class="yahoo-style-wrap" style="font-family:Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:16px;"><div dir="ltr" data-setdir="false"><div><div>Hi </div><div><br></div><div>I built a Singularity container with Ubuntu, GNU compilers and MVAPICH2 2.3.5 </div><div><br></div><div>When trying to run it on our cluster it fails with errors like:</div><div><br></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">Fatal error in PMPI_Waitall:</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">Other MPI error, error stack:</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">PMPI_Waitall(419)..................: MPI_Waitall(count=7, req_array=0x55d7f03d0290, status_array=0x55d7f03b4e50) failed</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">MPIR_Waitall_impl(248).............:</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">MPIDI_CH3I_Progress(285)...........:</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">handle_read(1350)..................:</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">handle_read_individual(1408).......:</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">MPIDI_CH3I_MRAIL_Parse_header(1502): Control shouldn't reach here in prototype, header %d</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2"> (errno 71)</font></div><div><br></div><div dir="ltr" data-setdir="false">As a test I also installed the same OS, compilers and libraries in an empty virtual machine (directly, without using singularity) and everything works without problem</div><div><br></div><div>Does this make any sense for you?</div><div><br></div><div>Vru</div></div><br></div></div></body></html>